После очередной победы команды Соника и срыва плана Эгммана по захвату мира, проходит небольшой период времени и происходят странности.
Буквально все команды и ключевые личности Сопротивления бесследно исчезают. Вот были и вот их нет.
Этой суматохой с исчезновением героев активно пользуется Эггман. Таким образом под контроль "Доктора" за малый период времени переходит где то 2/3 планеты.
Но ход событий резко меняется в один из дней.. Климат в некоторых частях планеты становится суровым и агрессивным, разделяя таким образом планету "штормовыми барьерами" на несколько частей. Преодоление таких "барьеров" на своих или транспорте близко к попытке умереть,из за сильных ветров/снегопадов или бурных морских вод. А некоторые территории планеты стали не пригодны из за эффекта который назвали "сбой". Не до конца не изученные пространственно-временные отклонения сделавшие непригодными для жизни участи на которых они появились.Как же обнаруживается.. что большая часть армии Доктора с началом "барьерной бури" не могут принимать сигналы от "мозгового центра" сводя поведения и возможности роботов порой до уровня картона. Эта особенность позволяет остаткам Сопротивления понять произошедшие, восстановится и даже дать отпор силам Эггмана запертыми вместе с ними на одной территории.
Так проходит 2-3 месяца в попытках наладить связь с другими частями Сопротивления оставшиеся по другие стороны "барьера" и между поселениями в приделах одного барьера. В этот момент важными становится "Райдеры". Те кто раньше ради трюков и ставок на гонки освоил гравиборд, стали на вес золото. Их маневренность и трюки позволили создать обмениваться информацией и товарами между городами, легко подстраиваясь под изменения "Сбоев".
В какой то момент Сопротивления в одних развалинах Ехидн обнаруживает одну их утерянных технологий этой расы. И ей является "Портальные врата". Специальные рамки настроенные на определенную волну других врат позволяли мгновенно и без проблем перемешаться меж 2 вратами. Вскоре Сопротивление осваивает способ создания врат и создает вскоре на их основе транспортную сеть, связывая таким способом города и поселения. Распространение порталов сказывается на работе Рейдеров, прямая нужна в них уменьшается, но если вам нужно что то тайно доставить в приделах одного барьера.. вы знаете к кому обращаться.
В процессе стройке сети, организуется "смертельная экспедиция". Участники этой экспедиции с большими потерями состава смогли преодолеть "штормовой барьер" пройдя горный перевал и доставить остаткам Сопротивления на той стороне Портальные врата. Жертва экспедиции позволила остаткам сопротивления иметь шансы на отступление к своим, ротацию, пополнение запасов.
Но вскоре оказалось что в рядах были шпионы Эггмана и вскоре такая же сеть порталов появилась и на его подконтрольных территориях.
В какой то момент Эггман попытался использовать порталы что бы забросить армию своих жестянок на территорию сопротивления.. Но попытка не увенчалась успехом и заглохла. После этого обе стороны приняли практическое одинаковые решения.. Портальные врата охранялись парой солдат с оружием и парой автоматических орудий, и если соединение приходилось со стороны вражеского портала, то охрана и орудия приходили в состояние готовности.
Так не имея возможности кусать друг друга, стороны продолжили существовать, пытаясь найти и находя способы как порой укусить оппонента.